Also grundsätzlich würde ich dir gerne nahe legen, dich ein wenig in die ganze Thematik einzulesen, sprich was für Voraussetzungen sind notwendig, wie kommt man auf den Server, was ist occ, wie führt man occ aus, etc. Das wird auf lange Sicht sicherlich hilfreich sein 
Eine Software wie Nextcloud benötigt während der Lebenszeit auch einfach eine gewisse Aufmerksamkeit (z.B. was Updates anbelangt).
So wie das aussieht installierst du Nextcloud bei einem Hoster, hier ist natürlich auch die Frage, ob da die Möglichkeiten mit Terminal und so überhaupt gegeben sind.
Wenn du Sqlite genommen hast, solltest du im data Verzeichnis eine Datei wie owncloud.db (hab jetzt auf die Schnelle nicht gefunden ob das mal irgendwann in nextcloud.db geändert wurde…) finden, welche deine Datenbank darstellt. Um das Setup noch mal zu starten, habe ich folgenden Beitrag gefunden: Accidentally picked SQLite db, how to change to MySQL? Habe ich selbst aber noch nicht probiert.
Man kann auch die Datenbank wechseln, dann sind wir aber wieder bei dem Thema occ 
Bevor du jetzt alles zurückdrehst, vielleicht trotzdem noch mal schauen, warum die Änderung an deiner config.php nicht übernommen wurde. Wenn ich per FileZilla eine Datei öffne, bearbeite und dann speichere fragt FileZilla ob die geänderte Datei wieder hochgeladen werden soll. Hast du das gemacht? Ist die Änderung auch vorhanden, wenn du die Datei danach erneut runterlädst?