Der Overhead beim Transfer einer grossen Daten durch DB sollte vernachlässigbar sein (bei kleineren kann das anders sein). Ich würde erst mal mit den grossen Files anfangen - rechnerisch ergibt sich aus 1,3GB und 2:30 Min eine Transferrate von knapp 70 MBit/s, selbst wenn wir davon ausgehen dass der Transfer 2 Min dauert und die restlichen 30 sec für die Verarbeitung drauf gehen macht das immer noch 86MBit/s und bei 1:30 über WebDAV 115MBit/s - das ist in etwa Fast Ethernet - aus diesen Daten würde ich den Flaschenhals erst mal im Netzwerk suchen - kontrolliere bitte ob du irgendwo eine Limitation hast - gewollt oder nicht. Wenn die grossen Dateien schnell genug laufen kann man bei den kleinen weiter suchen und Datenbank, Webserver usw analysieren.
Es gibt ein Paar Apps die die Sync Performance beeinflussen:
Collabora CODE app
External Storage app
schaue ob diese aktiv sind und deaktiviere sie testweise.
Das Thema wird immer wieder behandelt schaue dir entsprechende Threads hier im Forum an zB: