Mein Skript würde deine Nextcloud Instanz bei jedem Aufruf auf die nächste Major-Version hiefen. Da das Datenverzeichnis allerdings im Nextcloud-Verzeichnis liegt, würde es jedesmal mitgesichert. Da brauchst du viel Platz fürs Backup und es dauert entsprechend lange. Wenn du mein Skript benutzen möchtest, würde ich dir empfehlen zuerst das Datenverzeichnis aus dem Nextcloud-Verzeichnis rauszuschieben: HowTo: Change / Move data directory after installation
Daher hat Sanook vermutlich Recht, dass eine Neuinstallation den geringsten Aufwand bedeutet. Außer du hast viele Shares (Dateien/Kalender/Adressbücher geteilt).
Zum Exportieren von Kalendern und Adressbüchern habe ich auch ein Skript geschrieben: calcardbackup
Du kannst aber natürlich auch über das Webfrontend die Kalender/Adressbücher sichern.