Dafür kannst du mein Skript calcardbackup verwenden:
Es müsste genügen, calcardbackup mit dem Pfad zum Installationsordner von Nextcloud aufzurufen (Angabe weiterer Parameter in deinem Fall vermutlich nicht notwendig), dann sollten alle Kalender + Adressbücher der Installation gesichert werden.
Im repository findet sich auch ein deutsches README mit ausführlichen Erklärungen.