Wenn es nur um die Dateien geht, kannst du sie mit dem Nextcloud Client oder anderen WebDAV-Clients synchronisieren und dann wegsichern. Das Problem dürfte in diesem Fall eher die Datenbank sein, welche die ganzen User, Einstellungen, Kalendereinträge, Kontakte usw enthält. Wie oder ob du das überhaupt backupen kannst, hängt von deinem Hoster ab.
Wie gesagt… Die Dateien könntest du mit dem Netxloud Desktop Client auf einem lokalen PC synchronisieren und von dort aus nochmals auf ein NAS oder eine externe Festplatte sichern. Wenn du ein NAS hast, gibt es evtl. auch die Möglichkeit, dass sich das NAS die Dateien via WebDAV automatisiert von der Nextcloud abholt, um sie direkt zu sichern. Wenn du mehrere Benutzer hast, muss das natürlich jeder Benutzer selbst machen oder du musst seperate Sync/Backup Jobs per User einrichten.
Für die Datenbank, habe ich auch keine pauschale Lösung auf Lager. Da hängt es halt leider wirklich davon ab, was dir dein Hoster für Möglichkeiten bietet.
Leider ist der Server derart abgesichert, dass nicht die Standard-Tools zur Verfügung stehen.
Ich sehe es als eine Herausforderung an, und werde eine App entwickeln, mit der die Datenbank komplett gesichert und die Dateien von allen Anwendern auf eine beliebige Quelle gesichert werden können. - Mal schauen, ob es was wird